Φιλετάρουμε το σκουμπρί και το βάζουμε σε λαδόκολλα και αλουμινόχαρτο. Κόβουμε και προσθέτουμε το φινόκιο, την κάππαρη ψιλοκομμένη, το φιλέτο από το λεμόνι, το χυμό λεμονιού, το ελαιόλαδο και το θυμάρι. Τα τυλίγουμε σαν φάκελο, τα βάζουμε στο ταψί και τα ψήνουμε στο φούρνο, για 10 λεπτά, στους 200°C.