Ζεματάμε τις ντομάτας κι έπειτα τις ξεφλουδίζουμε. Τις κόβουμε σε μικρά κομματάκια και τις βάζουμε σε σαλατιέρα. Ρίχνουμε την ζάχαρη και το χυμό λεμονιού. Προσθέτουμε και το θυμάρι. Αφήνουμε να μαριναριστούν για τουλάχιστον δύο ώρες. Το μείγμα αυτό το αδειάζουμε έπειτα σε κατσαρόλα και βράζουμε σε χαμηλή φωτιά για μία ώρα περίπου. Βάζουμε σε αποστειρωμένα βαζάκια.